Jego miejsce zajął pierwszy wiceprezes Markku Lehtola, który będzie pełnił obowiązki prezesa do następnego walnego zgromadzenia i wyborów prezesa w październiku.

Niinistoe, polityk konserwatywnej partii Koalicja Narodowa, został prezesem Fińskiej Federarcji Piłkarskiej (Suomen Palloliitto) w 2009 roku, zastępując Pekkę Hamalainena. Jego wybór był krytykowany, jako decyzja polityczna, a Niinistoe nazywany był "politycznym spadochroniarzem spoza branży futbolu".

Objęcie stanowiska prezesa przez Niinistoe zbiegło się ze skandalami w związku z ustawianiem meczów w najwyższej fińskiej lidze Veikkausliiga. Rządy nowego prezesa stały pod znakiem słabych wyników reprezentacji, której nie udało się zakwalifikować do piłkarskich mistrzostw Europy, które odbędą się w tym roku w Polsce i na Ukrainie i w efekcie zerwaniem kontraktu z selekcjonerem Stuartem Baxterem.

Niinistoe w drugiej turze wyborów w niedzielę uzyskał 62,6 procent poparcia, wygrywając z Pekką Haavisto z partii Zielona Unia. Niinistoe będzie 12. prezydentem Finlandii. Został wybrany na 6-letnią kadencję.